Nous sommes en 2011. Cinq ans ont passé depuis le Second Désastre qui a éclipsé par sa gravité les événements d'avril 1986. La Zone est secouée de fréquentes explosions qui déplacent les champs d'anomalies et ouvrent de nouveaux passages vers des lieux auparavant inaccessibles. La faction des Stalkers se bat pour prendre le contrôle sur ces nouveaux territoires et lieux stratégiques. Les victimes sont nombreuses mais de nouvelles recrues ne cessent d'arriver.

L'action se déroule un an avant les événements de S.T.A.L.K.E.R.: Shadow of Chernobyl, un an avant l'incursion couronnée de succès de Strelok au cœur de la Zone - la troisième. Vous découvrirez ce qu'il est arrivé à Strelok et son escouade du point de vue d'un autre personnage.

La Zone vous attend : nouveaux lieux, menaces inconnues, trous noirs, monstres tapis dans le brouillard, nuits d'encre à attendre les rayons salvateurs du soleil. Essayez d'éviter les anomalies et les geysers, explorez la Zone pour y récolter des artéfacts, soignez-vous en cas d'irradiation et battez-vous pour la faction de Stalkers de votre choix ! Vous pourrez alors découvrir ce qu'il est advenu de Strelok, comment il a pu entrer dans le camion de la mort et comment il a obtenu son tatouage de S.T.A.L.K.E.R. sur le bras.